De halsdoek van Cunera is het verhaal van Cunera, de stadspatrones van Rhenen. De kerk die naar haar vernoemd is domineert al honderden jaren het stadsbeeld. Er is een lange weg naar haar vernoemd, een laan, een heuveltje, een school, een kringloop­winkel, likeur en koekjes. Waaraan heeft ze dat verdiend, en wie was ze eigenlijk?

In De halsdoek van Cunera raakt Emma, een scholiere uit Rhenen, verzeild in het Utrechtse Museum Catharijneconvent. Daar krijgt ze uitleg over de legende van de heilige Cunera en de verbanden met de geschiedenis van Rhenen. De belevenissen van Emma hebben de vorm van een fotostrip. De verhalen die ze tijdens haar bezoek aan het museum te horen krijgt, zijn getekend.